В среде сборки для выделенного элемента из СС можно вызвать замену, нажав кнопку Replace from Content Center...
Можно ли вызвать эту команду из API? - пробовал отследить ее в событиях активкоманд, но там что-то не то выводиться....
P. S. Как правильно следует идентифицировать элементы на принадлежность СС? Через содержание в FullFileName пути к СС?