Это подойдет для большинства случаев, по крайней мере по твоему вопросу про элементы. Это я к тому, что при получении bounding box-ов элементов, Transform будет Identity. Более общим решением может быть - по Min и Max построить 8 точек - углов куба и преобразовать их по этому Transform-у. В этом случае, возможно, будет удобнее работать с Outline, а не BoundingBoxXYZ