С характерками вообще не работаю, поэтому могу подсказать только направление:
1. Ищите в Civil3d .NET API Reference любые методы или свойства у объекта FeatureLine, которые могут вам помочь и пробуйте их использовать.
2. Если нужных свойств/методов нет (а это скорее всего так и будет), ищите то же самое в COM API. Как - это вопрос посложнее. Я до сих пор не знаю где найти такой толковый референс. Скорее всего, поможет Object Browser в Visual Studio.
3. Может оказаться, что в API Civil вообще нет способа редактировать FeatureLine. Но в нашем разделе, если мне память не изменяет, была тема по ее созданию с помощью COM. Тогда можно попробовать создать новую характерку по полилинии, выполнить подмену новой на старую с помощью метода SwapIdWith и удалить старую характерку.
Я бы действовал по такому плану.