1) Не будет MFC. Так что с созданием диалоговых окон будут сложности.
О каких сложностях Вы говорите, Александр? Если использовать тяжеловесный MFC только как инструмент создания диалоговых окон, то без него легко можно обойтись, например использую WTL. Я, например, так и поступаю. Т.е. связка Express + WTL - идеальный инструментарий для написания простых и шустрых приложений.
Так что сложность я вижу только одну (да и то временную) - освоение WTL.
Зато на выходе имеем:
1. Компактный код.
2. Отсутствие лицензионных проблем с MFC.
3. Легальная доступность Express студий.