Алексей, что-то как-то сложно у тебя получается. Если на C# меняются настройки внутри среды AutoCAD, то, как я понимаю, можно сделать так:
1. Создаётся .dll с командой изменения параметра скрытых сообщений при большом количестве масштабов.
2. В файле acaddoc.lsp проверяется имя компа по списку, пишется "netload @@@.dll" и вызывается команда для изменения параметра, описанная в этом dll. И всё. При закрытии AutoCAD уже сам сохранит новый параметр в файл FixedProfile.aws. Файл acaddoc.lsp грузится у всех пользователей, так что не надо ничего отлавливать.
Если так не прокатит, то BAT с изменением файла FixedProfile.aws. (У всех пользователей на System Start стоит выполнение bat-файла, который я периодически правлю, туда можно дописать). Наковырял всяких xml-редакторов, надо с ними разобраться, и ещё писать функцию чтения списка компов из текстового файла.)
При этом есть ещё один момент. Как выяснилось (написал прогу для отчёта), у многих пользователей вообще не установлено значение параметра скрытых сообщений при большом количестве масштабов. То есть у них каждый раз выскакивает окошко с предложением очистить