Вообще говоря, если у связанных документов связанного документа тип связи выбран "прикрепление", то они становятся видны в диспетчере проектов основного документа, а через API можно найти RevitLinkInstance связанного документа связанного документа.
Далеее получаете тип связанного документа RevitLinkType. У него есть ряд прекрасных методов, которые Вам позволят путешествовать по дереву связанных документов:
- GetChildIds
- GetParentId
- GetRootId