Можете подсказать где можно почитать чем один формат лучше другого по версиям Автокад?
Работать нужно с той версией dwg-файла, в которой по-умолчанию сохраняет установленная версия AutoCAD. Если версии AutoCAD разные, то нужно выбирать формат сохранения младшей. Если вы действительно до сих пор используете AutoCAD 2004...2006, то это единственная причина по которой следует сохранять в формате dwg-2004. Но тут я вам не помогу.
Из спортивного интереса я создал пустой файл и скопировал в него по очереди блоки с Lookup = Custom. Всё скопировалось нормально с сохранением Distance:
Проверял в AutoCAD 2020 со всеми обновлениями - в более ранних проверять нет смысла, т.к. если и был когда-то баг, то он уже исправлен.
Такое чувство, что начинка (не примитивы, а динамическая часть) у блоков Passage в твоих двух файлах разная.